医学康复系成立于2011年3月，现设办公室、学生管理科、教学管理科和五个教学研究室（康复、中医、口腔影像、药学、检验），目前，全系在校生近3000人。
一、 专业类别覆盖面全
涵盖康复治疗技术、社区康复、中医康复技术、口腔医学技术、医学检验技术、药学、药品生产技术、药品经营与管理、医学影像技术等九个专业。
二、 专业内涵成就高
康复治疗技术专业为山东省省级特色专业。
山东省五年制高职康复治疗技术专业教学指导方案制定牵头单位。
山东省中职康复技术专业教学指导方案制定牵头单位。
康复治疗技术专业为学院特色专业。
口腔医学技术专业为学院特色专业。
三、学历层次齐
专业培养涵盖本科（康复治疗技术专业与济宁医学院3+2贯通培养）、专科、中职三个层次。
四、师资队伍力量强
现有教师78人，其中专职教师53人，外聘教师19人，兼职教师2人，教授5人，副教授12人，讲师16人，双师型教师58人，研究生学历学位30人。其中全国教学指导委员会专家委员1人，省级教学指导委员会委员4人，市级教学名师1人，市拔尖人才1人，市级教学能手1人，校级教学名师3人。
五、技能竞赛取佳绩
多次组织学生参加国家级、省级、市级技能操作大赛，康复治疗技术、医学检验技术、口腔医学技术专业师生多次夺得竞赛大奖。
六、教学科研成绩突出
近年来撰写论文50余篇，主编参编著作、教材30余部，完成及在研课题30余项，获得荣誉50余项，我系刘晓枫老师荣获全国高职卫生类说课比赛二等奖。
七、实验实训设备齐全
为培养出适应新时代社会需求的高端技能型人才，学院和医学康复系在日常教学工作中注重理论与实践教学相结合，学校现有实验实训26个，面积近4000m2，实验实训设备齐全，设备价值400余万元，校外实习基地20余处，校企合作单位6处。
八、学生全面发展
医学康复系秉承德技并育理念，在传授专业理论知识的同时，注重学生综合素质的培养，经常开展丰富多彩的正面教育和文体活动，寓教育于活动之中，使学生德、智、体、劳得到全面发展。
十余年来，医学康复系蓬勃发展。在教学科研、学生管理等方面取得了可喜的成就，教学质量受到家长和社会、用人单位的广泛认可。近年来，我系毕业生深受社会青睐，毕业生供不应求。